Der Sunda-Gavial ist in seinem gesamten Verbreitungsgebiet komplexen, miteinander verknüpften Bedrohungen ausgesetzt. Habitatverlust und -fragmentierung durch Moor-Trockenlegung, Ausbau von Ölpalmenplantagen, Abholzung und Brände führten zu einem drastischen Verlust geeigneter Feuchtgebiete. Mit zunehmender Besiedlung nehmen Konflikte zwischen Menschen und Krokodilen zu, was oft zu Rachetötungen führt. Zumindest auf Sumatra scheint Gelegefrass durch eingeführte Wildschweine (Sus scrofa) eine erhebliche Bedrohung darzustellen. Nicht nachhaltige Fischerei, Geisternetze und Beifang erhöhen den Druck zusätzlich, doch ihre Auswirkungen sind noch kaum verstanden. Ungenügende Strafverfolgung und das Fehlen eines Langzeit-Monitorings erschweren unser Verständnis für Trends und die Wirksamkeit von Schutzmassnahmen. Der Klimawandel stört die für die Brut und die Beute wichtigen hydrologischen Verhältnisse zusätzlich. Trotz dieser zunehmenden Belastungen bleiben die Schutzmassnahmen ungenügend, lückenhaft und abhängig von wenigen engagierten Einzelnen und Freiwilligenteams mit begrenzten Ressourcen. Das Fehlen einer nachhaltige Koordination führt zu grossen Wissens- und Handlungslücken, die sowohl die Erholung der Art als auch die Integrität von Torfmoor-Ökosystemen wie dem Berbak-Nationalpark gefährden.